به طور كلي رنگ چشم بستگي به مقدار ماده اي به نام ملانين دارد. ملانين رنگدانه ي قهوه اي تيره است كه در عنبيه افراد وجود دارد. چشم آبي نشان دهنده ميزان كم ملانين است، در حالي كه چشم قهوه اي حاوي مقدار زيادي از اين ماده است. در نتيجه انسانهايي كه پوست و موي تيره دارند ، داراي مقدار زيادي ملانين هستند، بنابراين استعداد داشتن چشم قهوه اي را دارند ولي افرادي كه مو و پوست روشن دارند مقدار كمي از اين رنگدانه دارند و رنگ چشم اكثر آنها روشن است.

به همين علت است كه بيشتر نوزادان با چشم آبي به دنيا مي آيند ولي به مرور زمان وقتي بدن آنها شروع به توليد ملانين مي كند ، رنگ چشم آنها هم عوض مي شود.

وقتي كه يك انسان مقدار متفاوتي ملانين در هر يك از عنبيه هايش باشد، رنگ دو چشم او متفاوت خواهد بود.

 Chromia IridisHetero اصطلاح علمي براي داشتن رنگ چشم هاي متفاوت در يك جاندار تقريباً در انسانها نادر ، ولي در بسياري از حيوانات مثل اسب، گربه و بعضي از نژادهاي سگ رايج است.

اين خصوصيت ( داشتن دو رنگ چشم متفاوت در يك فرد) نتيجه تغييرات در يكي از ژنهايي است كه رنگ چشم را كنترل مي كنند كه مي تواند ارثي باشد. البته صدمات و يا بعضي از داروهاي خاص در افزايش و يا كاهش مقدار رنگدانه ها در يكي از عنبيه ها تاثير مي گذارد و يا حتي بعضي از سندرم ها مانند Syndrome Waardendurg مي تواند باعث بروز اين خصوصيت درفرد شود. البته درحاليكه گروهي از اين افراد از لنزهاي رنگي براي تطابق دو چشم خود استفاده مي كنند، عده اي ديگر به اين خصوصيت بارز خود مي بالند!